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EVO视讯细菌基因组DNA提取实验准备

来源:劳行哲 日期:2025-03-14

在细菌基因组DNA提取实验中,经过细菌的培养与收集,我们获得了足够的菌体,接下来的关键步骤是细胞裂解。此步骤旨在破坏细菌的细胞壁和细胞膜以释放DNA。我们采用了化学与物理方法相结合的策略,首先用特定的酶处理样品,这些酶能特异性降解细菌的细胞壁成分,随后通过超声波或法式压碎法进一步破碎细胞,确保DNA的充分释放。

EVO视讯细菌基因组DNA提取实验准备

完成细胞裂解后,我们面临一个重要挑战——如何有效地分离和纯化DNA。在此过程中,我们利用DNA在不同盐浓度和pH值下的溶解度差异,通过一系列有机溶剂的抽提步骤,能够有效去除蛋白质和多糖等杂质,同时保护DNA防止降解。每一步操作都需谨慎,避免剧烈振荡,以防止DNA断裂。

实验步骤

一、试剂盒组成、贮存与稳定性

1. 试剂盒目录:包括说明书、DNA制备管、小量滤器、2ml离心管和15ml离心管。

2. RNaseA:50mg/ml,室温保存。

3. *:50%的甘油溶解*,使其浓度为50mg/ml,-20℃密闭储存。

4. BufferS:细菌原生质制备液,加入RNaseA后,4℃密闭储存。

5. 025MEDTA:室温密闭储存。

6. BufferG-A:裂解液,室温密闭储存。

7. BufferG-B:蛋白去除液,室温密闭储存。

8. BufferDV-A:请参照实验准备BufferDV的配制方法,室温密闭储存。

9. BufferDV:相分离液,室温密闭储存。

10. BufferBV:DNA结合液,室温密闭储存。

11. BufferW1:洗涤液,室温密闭储存。

12. BufferW2concentrate:去盐液,使用前根据试剂瓶指示加入无水乙醇并混合均匀,室温密闭储存。

13. Eluent:25mMTris-HCl,pH8.5,室温密闭储存。

二、实验准备

1. 第一次使用时,在BufferW2中按指示加入无水乙醇并混合均匀。

2. 准备BufferDV:取2ml BufferDV-A与125ml异丙醇混合,放入提供的250ml试剂瓶中,搅拌均匀。

3. 将BufferDV预冷至4℃。

4. 每次使用试剂盒时,用50%甘油溶解*,使其浓度为50mg/ml。

5. 每次使用时时将随试剂盒携带的RNaseA全部加入BufferS中,混合均匀。

6. 准备65℃的水浴。

7. 检查BufferG-A和BufferG-B是否出现沉淀,如有,需在65℃水浴加热至沉淀溶解后使用。

8. 将Eluent或去离子水加热至65℃,以促进DNA的充分洗脱。

三、操作步骤

1. 用2ml离心管收集10×109(1ml菌液OD600为1-15)的细菌培养物,12000×g离心30秒,弃尽上清。用150μl已加入RNaseA的BufferS悬浮沉淀,确保悬浮均匀,避免小的菌块影响溶菌效果。

2. 加入20μl*贮存液,混合均匀,室温静置5分钟。

3. 加入30μl 025MEDTA(pH8.0),混合均匀,冰浴5分钟。

4. 加入450μl BufferG-A,旋涡振荡15秒,在65℃水浴中反应10分钟。

5. 接着加入400μl BufferG-B和1ml BufferDV(需预冷),用力混合,12000×g离心2分钟。

6. 尽可能丢弃上相,保留相间沉淀和下相。加入1ml 4℃预冷的BufferDV,用力混合,12000×g离心2分钟。

7. 丢弃上相,将下相转移至滤器(滤器置于2ml离心管中),12000×g离心1分钟。

8. 弃滤器,在滤液中加入400μl BufferBV,混合均匀。选择离心法或负压法进行后续步骤。

通过负压法或离心法将提纯的DNA从溶液中析出。最终,通过乙醇沉淀法,将DNA进一步提纯,这一过程需在低温下进行,以提高DNA的沉淀率。沉淀物经过离心收集后,用70%乙醇洗涤数次,以去除残留的盐类和有机溶剂,从而保证DNA纯度。

最后,将洗涤后的DNA沉淀晾干,并用TE缓冲液溶解,获得的细菌基因组DNA溶液经过电泳检测显示出清晰的DNA条带,证明提取效果良好。整个细菌基因组DNA提取实验已圆满结束,为后续的分子生物学研究奠定了坚实基础,也充分体现了EVO视讯在生物医疗领域的应用潜力。

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